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　　主要还是与胃肠道的肿瘤性疾病相鉴别，最常见的比如说胃癌、肠癌，当然胃癌、肠癌跟胃肠道间质瘤的来源是不一样的，胃肠道间质瘤是来源于胃粘膜下的间叶来源，而胃癌、肠癌主要是来源于胃肠粘膜本身，这种上皮细胞的肿瘤，是来源不一样，但是通过在CT有可能有一定的类似程度，所以需要进行胃镜下的鉴别。

　　第二个就是胃肠道的良性的平滑肌瘤，但是这个通过胃镜或肠镜，比较容易鉴别。胃肠道平滑肌瘤，在CT或者是内镜下表现的非常典型的清洁，干净，整齐，甚至是我们可以看到很漂亮完整的一个局限性隆起，这个和胃肠道间质瘤在中晚期或者中高危的时候是不同的。

　　另外对于一些神经内分泌肿瘤在胃肠道的出现，这个时候需要鉴别，但这个鉴别有时候单纯CT或者是胃肠镜影像鉴别有一定的困难，有时候需要进行神经内分泌激素的水平的化验来鉴别。当然还有一个相对难鉴别的，就是胃肠道的平滑肌肉瘤，这个往往需要进行病理穿刺的活检来鉴别。

　　专家提示：胃肠道间质瘤容易与以下疾病混淆：胃肠道肿瘤性疾病、胃肠道平滑肌瘤、神经内分泌肿瘤、胃肠道平滑肌肉瘤等，需要CT检查、胃肠镜检查、病理穿刺活检或神经内分泌激素检查等进行鉴别诊断。

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